Job title: PE_PGRS50
Job code: GYPfpz6A - Submitted by Anonymous on 2020-06-10 12:24:58
Sequence name:
SEQ_47205 1538 BP
Submitted sequence:
MVMSLMVAPELVAAAAADLTGIGQAISAANAAAAGPTTQVLAAAGDEVSAAIAALFGTHA
QEYQALSARVATFHEQFVRSLTAAGSAYATAEAANASPLQALEQQVLGAINAPTQLWLGR
PLIGDGVHGAPGTGQPGGAGGLLWGNGGNGGSGAAGQVGGPGGAAGLFGNGGSGGSGGAG
AAGGVGGSGGWLNGNGGAGGAGGTGANGGAGGNAWLFGAGGSGGAGTNGGVGGSGGFVYG
NGGAGGIGGIGGIGGNGGDAGLFGNGGAGGAGAAGLPGAAGLNGGDGSDGGNGGTGGNGG
RGGLLVGNGGAGGAGGVGGDGGKGGAGDPSFAVNNGAGGNGGHGGNPGVGGAGGAGGLLA
GAHGAAGATPTSGGNGGDGGIGATANSPLQAGGAGGNGGHGGLVGNGGTGGAGGAGHAGS
TGATGTALQPTGGNGTNGGAGGHGGNGGNGGAQHGDGGVGGKGGAGGSGGAGGNGFDAAT
LGSPGADGGMGGNGGKGGDGGKAGDGGAGAAGDVTLAVNQGAGGDGGNGGEVGVGGKGGA
GGVSANPALNGSAGANGTAPTSGGNGGNGGAGATPTVAGENGGAGGNGGHGGSVGNGGAG
GAGGNGVAGTGLALNGGNGGNGGIGGNGGSAAGTGGDGGKGGNGGAGANGQDFSASANGA
NGGQGGNGGNGGIGGKGGDAFATFAKAGNGGAGGNGGNVGVAGQGGAGGKGAIPAMKGAT
GADGTAPTSGGDGGNGGNGASPTVAGGNGGDGGKGGSGGNVGNGGNGGAGGNGAAGQAGT
PGPTSGDSGTSGTDGGAGGNGGAGGAGGTLAGHGGNGGKGGNGGQGGIGGAGERGADGAG
PNANGANGENGGSGGNGGDGGAGGNGGAGGKAQAAGYTDGATGTGGDGGNGGDGGKAGDG
GAGENGLNSGAMLPGGGTVGNPGTGGNGGNGGNAGVGGTGGKAGTGSLTGLDGTDGITPN
GGNGGNGGNGGKGGTAGNGSGAAGGNGGNGGSGLNGGDAGNGGNGGGALNQAGFFGTGGK
GGNGGNGGAGMINGGLGGFGGAGGGGAVDVAATTGGAGGNGGAGGFASTGLGGPGGAGGP
GGAGDFASGVGGVGGAGGDGGAGGVGGFGGQGGIGGEGRTGGNGGSGGDGGGGISLGGNG
GLGGNGGVSETGFGGAGGNGGYGGPGGPEGNGGLGGNGGAGGNGGVSTTGGDGGAGGKGG
NGGDGGNVGLGGDAGSGGAGGNGGIGTDAGGAGGAGGAGGNGGSSKSTTTGNAGSGGAGG
NGGTGLNGAGGAGGAGGNAGVAGVSFGNAVGGDGGNGGNGGHGGDGTTGGAGGKGGNGSS
GAASGSGVVNVTAGHGGNGGNGGNGGNGSAGAGGQGGAGGSAGNGGHGGGATGGDGGNGG
NGGNSGNSTGVAGLAGGAAGAGGNGGGTSSAAGHGGSGGSGGSGTTGGAGAAGGNGGAGA
GGGSLSTGQSGGPRRQRWCRWQRRRWLGRQRRRRWCRWQRRCRRQRWRWRCRQRRLRRQW
RQGRRRCRPWLHRRRGRQGRRWRQRRFQQRQRSRWQRR
QEYQALSARVATFHEQFVRSLTAAGSAYATAEAANASPLQALEQQVLGAINAPTQLWLGR
PLIGDGVHGAPGTGQPGGAGGLLWGNGGNGGSGAAGQVGGPGGAAGLFGNGGSGGSGGAG
AAGGVGGSGGWLNGNGGAGGAGGTGANGGAGGNAWLFGAGGSGGAGTNGGVGGSGGFVYG
NGGAGGIGGIGGIGGNGGDAGLFGNGGAGGAGAAGLPGAAGLNGGDGSDGGNGGTGGNGG
RGGLLVGNGGAGGAGGVGGDGGKGGAGDPSFAVNNGAGGNGGHGGNPGVGGAGGAGGLLA
GAHGAAGATPTSGGNGGDGGIGATANSPLQAGGAGGNGGHGGLVGNGGTGGAGGAGHAGS
TGATGTALQPTGGNGTNGGAGGHGGNGGNGGAQHGDGGVGGKGGAGGSGGAGGNGFDAAT
LGSPGADGGMGGNGGKGGDGGKAGDGGAGAAGDVTLAVNQGAGGDGGNGGEVGVGGKGGA
GGVSANPALNGSAGANGTAPTSGGNGGNGGAGATPTVAGENGGAGGNGGHGGSVGNGGAG
GAGGNGVAGTGLALNGGNGGNGGIGGNGGSAAGTGGDGGKGGNGGAGANGQDFSASANGA
NGGQGGNGGNGGIGGKGGDAFATFAKAGNGGAGGNGGNVGVAGQGGAGGKGAIPAMKGAT
GADGTAPTSGGDGGNGGNGASPTVAGGNGGDGGKGGSGGNVGNGGNGGAGGNGAAGQAGT
PGPTSGDSGTSGTDGGAGGNGGAGGAGGTLAGHGGNGGKGGNGGQGGIGGAGERGADGAG
PNANGANGENGGSGGNGGDGGAGGNGGAGGKAQAAGYTDGATGTGGDGGNGGDGGKAGDG
GAGENGLNSGAMLPGGGTVGNPGTGGNGGNGGNAGVGGTGGKAGTGSLTGLDGTDGITPN
GGNGGNGGNGGKGGTAGNGSGAAGGNGGNGGSGLNGGDAGNGGNGGGALNQAGFFGTGGK
GGNGGNGGAGMINGGLGGFGGAGGGGAVDVAATTGGAGGNGGAGGFASTGLGGPGGAGGP
GGAGDFASGVGGVGGAGGDGGAGGVGGFGGQGGIGGEGRTGGNGGSGGDGGGGISLGGNG
GLGGNGGVSETGFGGAGGNGGYGGPGGPEGNGGLGGNGGAGGNGGVSTTGGDGGAGGKGG
NGGDGGNVGLGGDAGSGGAGGNGGIGTDAGGAGGAGGAGGNGGSSKSTTTGNAGSGGAGG
NGGTGLNGAGGAGGAGGNAGVAGVSFGNAVGGDGGNGGNGGHGGDGTTGGAGGKGGNGSS
GAASGSGVVNVTAGHGGNGGNGGNGGNGSAGAGGQGGAGGSAGNGGHGGGATGGDGGNGG
NGGNSGNSTGVAGLAGGAAGAGGNGGGTSSAAGHGGSGGSGGSGTTGGAGAAGGNGGAGA
GGGSLSTGQSGGPRRQRWCRWQRRRWLGRQRRRRWCRWQRRCRRQRWRWRCRQRRLRRQW
RQGRRRCRPWLHRRRGRQGRRWRQRRFQQRQRSRWQRR
Prediction status: completed
Prediction summary:
Cell Membrane, 2 Transmembrane helices
Detailed prediction results
Predicted membrane localization (MemLoci): Cell Membrane
Cell membrane score: 96%
Internal membrane score: -99%
Organelle membrane score: 57%
Predicted sequence features:
| Prediction | Presence | Start | End | Detail |
|---|---|---|---|---|
| Signal peptide (SPEP): | YES | 1 | 25 | view on sequence |
| Non cytoplasmic region (ENSEMBLE): | - | 26 | 42 | view on sequence |
| Transmembrane region (ENSEMBLE): | YES | 43 | 57 | view on sequence |
| Cytoplasmic region (ENSEMBLE): | - | 58 | 65 | view on sequence |
| Transmembrane region (ENSEMBLE): | YES | 66 | 80 | view on sequence |
| Non cytoplasmic region (ENSEMBLE): | - | 81 | 1538 | view on sequence |
| GPI anchor (PredGPI): | NO | - | - | not present |
Annotation of similar proteins in SwissProt
loading...